淞南镇位于宝山区境的东南部，东临黄浦江，与浦东新区隔江相望，西以泗塘河为界与张庙街道为邻，北靠蕰藻浜与杨行镇、吴淞街道接壤，南与杨浦区五角场镇、宝山区高境镇毗邻，总面积为13.65平方公里。实际可规划面积4.25平方公里。淞南镇位于东经120°30′，北纬31°23′8″，距市中心约17公里。镇境中部长江路连长江西路贯穿东西，北部为吴淞工业区，南部主要为居民住宅区。淞南镇地势平坦，东南、西南地势最低。全镇南北宽3.045公里，东西长6.3公里，总面积为13.65平方公里。 淞南镇内河属长江流域太湖区黄浦江水系，境内西泗塘河向北及南泗塘河朝东转北流入蕰藻浜，东南黄浦江北出吴淞口，形成“三纵两横”水系。 淞南镇受冷暖空气交替影响，四季分明，温暖湿润，雨量充沛，光照充足，无霜期长。春季冷暖多变，夏季持续高温，秋季降温较快，冬季寒冷干燥。镇域内时有自然灾害，主要有水灾、风灾、冰雹等。 淞南镇域土壤系起源草甸土，在长期种植过程中发育成水稻土。